在贏得總統大選後的新聞發佈會上，馬英九談到兩岸和談的議題將不會優先於臺灣的經濟重振。並要求中共必須先撤除瞄準臺灣的導彈。

對於馬英九贏得臺灣總統選舉勝利，美國總統布什星期六也發表祝賀，布什說這個結果提供一個讓中國與臺灣和平解決歧見的「新契機」。

中共當局目前尚未放棄武力征服臺灣。1996年臺灣大選之際，中共當局曾經在臺灣海峽試射導彈，試圖恐嚇選民，但結果適得其反。對這次臺灣大選中共當局採取了低調。

而在北京當局武力鎮壓西藏藏民的抗議活動之後，馬英九和謝長庭都對中共採取了更加強硬的姿態。